Pour la première fois, les éliminatoires de la Coupe d’Afrique des Nations des moins de 17ans vont se jouer par zone géographique comme le prévoit les resolutions du Symposium Africain de Football de la CAF en juillet 2017 à Rabat.
Selon la Confédération Africaine de Foot-ball, chaque union organisera les éliminatoires entre les pays de sa zone, les champions des six (6) zones à avoir CECAFA, COSAFA, UNAF, UNIFFAC, WAFU A, WAFU B, le Mali ( Vainqueur de la CAN U17 -2017) et la Tanzanie ( pays hôte) seront qualifiés pour les phases finales de la CAN U17 2019 .
La phase de qualification va se jouer entre le mois de Juillet et Septembre à Maurice (COSAFA), se poursuivra en Guinée équatoriale (UNIFFAC), en Tanzanie (CECAFA), en Tunisie (UNAF), au Niger (WAFU B) et se terminera au Sénégal (WAFU).
À préciser que tous les joueurs sélectionnés pour le tournoi seront soumis à l’imagerie par résonance magnétique (IRM) obligatoire pour déterminer leur admissibilité à participer.